原本是天台宗的寺院,据说在室町时代的文明7年(1475年),莲如上人(净土真宗的创始人)从越前吉崎(福井县芦原市吉崎地区。净土真宗的一个据点)经小滨去往京都途中,曾在若狭地区停留约100天,其间也在得法寺逗留。据说此时该寺院皈依了莲如上人,改信净土真宗。六字佛号“南无阿弥陀佛”的挂轴如今依然被尊为寺宝,由于是在来自吉崎的船中写成,还被称为“船路名号”。
元龟元年(1570年),织田信长率领丰臣秀吉与德川家康为了攻打越前国(福井县北部)的朝仓义景,从京都经熊川向敦贺出发。据《信长公记》记载,信长曾在熊川的松宫玄蕃寮之处住宿,而传闻当时德川家康便是住在得法寺(过去也写作德法寺)。寺内东隅有棵据说当时德川家康坐在上面休息的树,被称为“家康腰挂之松”(“腰挂”即坐下之意),可惜于近年枯死了。
此外,该寺院还秘藏着后水尾天皇亲笔的“东照大权现”真迹,据称该真迹是日光东照宫阳明门的天皇亲笔匾额的草稿。
在得法寺墓地有一座供奉熊川城主沼田氏的灵塔,据说熊川是细川幽斋(藤孝)之妻麝香的老家。推测该塔是在室町时代中期左右建成,过去是一座五层塔。