若狹神宮寺是在和銅7年（714年），因若狹比古神脫離神道歸依佛門而創建的寺院。創建當初，被稱為若狹比古神願寺。鎌倉時代以後成為天台宗寺院，名為若狹一宮（該地區社格最高的神社）根本神宮寺。
送水儀式是以取自寺域內閼伽井的「香水」進行、寺域內曾挖出與平城宮同型態的瓦片等，這些均顯示出這裡自古便與奈良有所相關。
戰國時代由越前朝倉氏重建的本堂，已被指定為重要文化財（國家指定重要文物）。還可在同樣被指定為重要文化財的北門（仁王門）到本堂之間，遙想過去的寺院遺跡。本堂旁安置著傳聞以若狹彥姫神為藍本雕刻的木造男、女神像。
